Crédito: Universidad de Cornell
Crédito: Universidad de Cornell

Herramienta informática predice uniones de coronavirus con proteínas humanas

Una herramienta computacional permite a los investigadores predecir con precisión las ubicaciones en las superficies de las proteínas humanas y virales COVID-19 que se unen entre sí, un avance que beneficiará enormemente nuestra comprensión del virus y el desarrollo de fármacos que bloquean los sitios de unión. Los desarrolladores de la herramienta han proporcionado un servidor web interactivo fácil de usar que muestra todas las estructuras de proteínas, de modo que los virólogos y médicos sin habilidades computacionales pueden hacer uso de los modelos de proteínas para ver si los medicamentos existentes o los que están en desarrollo encajan en los sitios de unión adecuados. El estudio, publicado el 29 de noviembre en Nature Methods , describe la herramienta y la usa para predecir cómo el SARS-COV-2 divergió estructuralmente…

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Los investigadores han producido un atlas de cromatina unicelular para el genoma humano

Investigadores de la Universidad de California en San Diego han elaborado un atlas de cromatina unicelular para el genoma humano.  La cromatina es un complejo de ADN y proteína que se encuentra en las células eucariotas; las regiones de cromatina en los elementos reguladores de genes clave aparecen en configuraciones abiertas dentro de ciertos núcleos celulares.  Delinear con precisión estas regiones de cromatina accesibles en células de diferentes tipos de tejidos humanos sería un paso importante hacia la comprensión del papel de los elementos reguladores de genes (ADN no codificante) en la salud o enfermedad humana. Los hallazgos aparecen en línea en la edición de Cell del 12 de noviembre de 2021 . Para los científicos, el genoma humano, conocido popularmente como el "libro de la vida", no está…

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Software para leer códigos genéticos alternativos

Yekaterina “Kate” Shulgina era una estudiante de primer año en la Escuela de Graduados en Artes y Ciencias de la Universidad de Harvard, y buscaba un proyecto corto de biología computacional para poder verificar el requisito de su programa en biología de sistemas.  Se preguntó cómo el código genético, que alguna vez se pensó que era universal, podría evolucionar y cambiar. Eso fue en 2016 y hoy Shulgina ha salido al otro lado de ese proyecto a corto plazo con una forma de descifrar este misterio genético. Ella lo describe en un nuevo artículo en la revista eLife con el biólogo de Harvard Sean Eddy. El informe detalla un nuevo programa informático que puede leer la secuencia del genoma de cualquier organismo y luego determinar su código genético. …

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Los ancestros de los tiburones ballena en Panamá pueden provenir de aguas lejanas alrededor del mundo

El pez más grande del mundo, el tiburón ballena ( Rhincodon typus ), es un gigante amante del plancton que se puede encontrar solo o en grupos en todos los océanos tropicales.  Sin embargo, a pesar de ser una especie altamente migratoria, se sabe poco sobre cómo interactúan entre sí las diferentes poblaciones de todo el mundo.  Esta falta de conocimiento dificulta los esfuerzos de conservación destinados a proteger a este animal en peligro de extinción.  Héctor Guzmán, biólogo marino del Instituto Smithsonian de Investigaciones Tropicales, junto con Caitlin Beaver del Servicio Geológico de Estados Unidos y Edgardo Díaz-Ferguson de la Estación Científica Coiba, se propusieron comenzar a cerrar esta brecha de conocimiento. Buceando alrededor del Parque Nacional Coiba y en el Golfo de Chiriquí, en el…

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